Avec 480 000 visiteurs en un an (450 000 prévus), l'Aquarium Mare Nostrum rencontre un joli succès, grâce à sa diversité (300 espèces), à son attraction phare (la tempête australe à bord d'un cargo), son grand bassin (18m de diamètre, 9,50m de hauteur) et son enrichissement permanent, puisque 30 nouvelles espèces ont été accueillies.

Ce résultat a poussé l'Agglomération de Montpellier à engager début 2009, une phase d'extension avec de nouveaux espaces d'exposition, un amphithéâtre de 200 places et 3 salles d'animations pédagogiques.

Dès à présent, une caméra sous-marine présente en direct et gros plan, la vie des petits animaux de mer : pieds de l'étoile de mer, yeux du bernard-l'ermite ou bouche du concombre de mer…